Om lid te kunnen worden van de Fondunie 2000 dient men ingeschreven te zijn in het ledenregister van een NPO-Basisvereniging van een van de afdelingen 7, 8, 9, 10 of 11 en te beschikken over een geldig NPO-lidnummer.

Door in enig kalenderjaar deel te nemen aan minstens een wedvlucht van de Fondunie 2000, is men gedurende dat jaar lid van de Fondunie 2000. De leden betalen geen contributie.